Onderdeel van de pijler TAAG-technologie, samen met kunstmatige intelligentie in de microbiologie.
Het probleem: een curve interpreteren is minder eenvoudig dan het lijkt
Het ruwe resultaat van een realtime-PCR-reactie is een fluorescentiecurve die stijgt naarmate het genetische doelmateriaal wordt geamplificeerd. Beslissen of die curve een positief, negatief of twijfelachtig resultaat weergeeft, vraagt om beoordeling van bij welke cyclus ze een bepaalde drempel passeerde, van de vorm van de curve en, bij multiplexbepalingen, om het gelijktijdig onderscheiden van signalen uit verschillende kleurkanalen. Dat handmatig doen, bepaling voor bepaling, is traag en laat ruimte voor verschillen tussen analisten.
Wat is TxA?
TxA is de software van TAAG die deze interpretatie automatiseert: ze analyseert de amplificatiecurve (of smeltcurve, afhankelijk van de kittechnologie) die het PCR-apparaat genereert en bepaalt automatisch of het resultaat positief of negatief is voor elk onderzocht doelwit, volgens de technische documentatie van de kits uit de lijnen Ampliora, Elevia en Specio.
Waarom automatische interpretatie ertoe doet
Consistentie tussen analisten en ploegen
Een interpretatiecriterium dat automatisch en gestandaardiseerd wordt toegepast, vermindert de variatie die handmatig aflezen door verschillende analisten of ploegen kan veroorzaken.
Snelheid in laboratoria met grote aantallen
In laboratoria die honderden monsters per dag verwerken, verkort automatische interpretatie de tijd tussen het einde van de PCR-run en het moment waarop het resultaat beschikbaar is voor een vrijgavebeslissing.
Onderdeel van een bredere trend: digitalisering van het laboratorium
TxA past in een bredere beweging in de industriële microbiologie: het beheer van resultaten verplaatsen van spreadsheets en handmatige aflezingen naar geïntegreerde digitale systemen die de laboratoriumapparatuur rechtstreeks met de eindrapportage verbinden, waardoor er minder momenten van handmatige overname zijn waar fouten kunnen ontstaan.
Conclusie
Veel van de waarde van een snelle PCR-kit gaat verloren als de interpretatie van het resultaat een traag, handmatig proces blijft. TxA lost dat laatste stuk van het werkproces op, door het signaal van het apparaat rechtstreeks te koppelen aan een geïnterpreteerd resultaat.
Over TAAG
Ontdek hoe TxA integreert met de kits van TAAG om de interpretatie van PCR-resultaten te automatiseren.
Veelgestelde vragen
Vervangt TxA de laboratoriumanalist?
Nee; ze automatiseert de interpretatie van de fluorescentiecurve, maar de analist blijft verantwoordelijk voor de uitvoering van de bepaling en de algemene validatie van het proces.
Werkt TxA met elk PCR-apparaat?
Ze is ontworpen om te integreren met de kits van TAAG (Ampliora, Elevia, Specio); compatibiliteit met apparatuur en processen van andere leveranciers moet rechtstreeks bij TAAG worden nagevraagd.
Wat wint een laboratorium door de interpretatie te automatiseren?
Meer consistentie tussen analisten en ploegen, en minder tijd tussen het einde van de PCR-run en de beschikbaarheid van het eindresultaat.