Questo articolo apre il pilastro di tecnologia TAAG del Centro di Apprendimento. Continua con intelligenza artificiale in microbiologia.
Il problema che Mila risolve
Progettare un buon primer o una buona sonda per PCR — la sequenza corta che determina quale regione genetica verrà amplificata e rilevata — è un problema combinatorio: esistono milioni di combinazioni possibili di sequenze candidate, e scegliere quella ottimale richiede di valutare simultaneamente specificità (che non riconosca microrganismi non bersaglio), sensibilità e compatibilità con altri primer se il test sarà multiplex. Farlo manualmente è un processo lento e dipendente dall'esperienza del progettista.
Che cos'è Mila?
Mila è, secondo quanto descrive TAAG, la prima piattaforma al mondo che utilizza l'intelligenza artificiale per progettare e selezionare automaticamente il miglior set di primer e sonde tra milioni di combinazioni possibili. Invece che uno specialista valuti manualmente un numero limitato di candidati, il sistema valuta in modo esaustivo lo spazio delle combinazioni e seleziona quelle con la migliore prestazione prevista.
Dove si applica all'interno del catalogo TAAG?
Mila è una tecnologia trasversale, integrata nelle linee di kit Ampliora ed Elevia di TAAG, il che significa che la progettazione assistita da IA non è un prodotto a sé, ma il processo dietro lo sviluppo degli stessi kit PCR che l'industria alimentare utilizza per rilevare patogeni e microrganismi di deterioramento.
Benefici riportati rispetto alla progettazione manuale
Maggiore precisione del test
Valutando più combinazioni in modo sistematico, la piattaforma punta a massimizzare sensibilità e specificità del primer/sonda selezionato rispetto a quanto otterrebbe una selezione manuale limitata.
Design multiplex più robusti
Una delle maggiori sfide della PCR multiplex è evitare che i diversi set di primer interferiscano tra loro. Un sistema che valuta combinazioni su larga scala può identificare set che minimizzano questa interferenza con maggiore coerenza rispetto a un processo manuale.
Tempi di sviluppo più brevi
TAAG riporta che, grazie a Mila, il processo dal concetto di un nuovo kit alla sua disponibilità può richiedere solo poche settimane. (Cifra riportata da TAAG; il tempo esatto può variare in base alla complessità del test e va confermato caso per caso.)
Conclusione
La progettazione di un test PCR affidabile dipende da una decisione che avviene molto prima che il campione arrivi in laboratorio: quale sequenza esatta cercare. Automatizzare questa decisione con l'intelligenza artificiale è ciò che Mila apporta allo sviluppo dei kit di TAAG.
Informazioni su TAAG
Scopri come Mila fa parte del processo di sviluppo dei kit Ampliora ed Elevia di TAAG.
Domande frequenti
Mila sostituisce l'analista che valida il kit finale?
No; Mila assiste nella fase di progettazione computazionale del primer/sonda, ma il kit risultante continua a passare attraverso una validazione sperimentale prima del suo lancio.
Mila viene usata per progettare un solo tipo di kit?
È integrata in più di una linea di prodotto di TAAG (Ampliora ed Elevia), per cui la sua applicazione non si limita a un unico tipo di test.
Che differenza c'è tra Mila e AiGOR?
Mila progetta i primer/sonde usati nella reazione di PCR; AiGOR è la tecnologia di rilevamento basata su RNA integrata nella linea Elevia. Sono livelli distinti e complementari dello stesso kit.