Este artículo abre el pilar de tecnología TAAG del Centro de Aprendizaje. Continúa con inteligencia artificial en microbiología.
El problema que resuelve Mila
Diseñar un buen primer o sonda para PCR —la secuencia corta que determina qué región genética se va a amplificar y detectar— es un problema combinatorio: existen millones de combinaciones posibles de secuencias candidatas, y elegir la óptima requiere evaluar simultáneamente especificidad (que no reconozca microorganismos no objetivo), sensibilidad y compatibilidad con otros primers si el ensayo será multiplex. Hacerlo manualmente es un proceso lento y dependiente de la experiencia del diseñador.
¿Qué es Mila?
Mila es, según describe TAAG, la primera plataforma del mundo que utiliza inteligencia artificial para diseñar y seleccionar automáticamente el mejor conjunto de primers y sondas entre millones de combinaciones posibles. En lugar de que un especialista evalúe manualmente un número limitado de candidatos, el sistema evalúa exhaustivamente el espacio de combinaciones y selecciona las de mejor desempeño predicho.
¿Dónde se aplica dentro del catálogo de TAAG?
Mila es una tecnología transversal, integrada en las líneas de kits Ampliora y Elevia de TAAG, lo que significa que el diseño asistido por IA no es un producto aparte, sino el proceso detrás del desarrollo de los propios kits PCR que la industria alimentaria utiliza para detectar patógenos y microorganismos de deterioro.
Beneficios reportados frente al diseño manual
Mayor precisión de ensayo
Al evaluar más combinaciones de forma sistemática, la plataforma busca maximizar sensibilidad y especificidad del primer/sonda seleccionado frente a lo que lograría una selección manual limitada.
Diseños multiplex más robustos
Uno de los mayores desafíos de la PCR multiplex es evitar que los distintos juegos de primers interfieran entre sí. Un sistema que evalúa combinaciones a gran escala puede identificar conjuntos que minimizan esa interferencia con mayor consistencia que un proceso manual.
Tiempos de desarrollo más cortos
TAAG reporta que, gracias a Mila, el proceso desde el concepto de un nuevo kit hasta su disponibilidad puede tomar solo semanas. (Cifra reportada por TAAG; el tiempo exacto puede variar según la complejidad del ensayo y debe confirmarse caso por caso.)
Conclusión
El diseño de un ensayo de PCR confiable depende de una decisión que ocurre mucho antes de que la muestra llegue al laboratorio: qué secuencia exacta va a buscar. Automatizar esa decisión con inteligencia artificial es lo que Mila aporta al desarrollo de los kits de TAAG.
Sobre TAAG
Conoce cómo Mila forma parte del proceso de desarrollo de los kits Ampliora y Elevia de TAAG.
Preguntas frecuentes
¿Mila reemplaza al analista que valida el kit final?
No; Mila asiste en la etapa de diseño computacional del primer/sonda, pero el kit resultante sigue pasando por validación experimental antes de su lanzamiento.
¿Mila se usa para diseñar un solo tipo de kit?
Está integrada en más de una línea de producto de TAAG (Ampliora y Elevia), por lo que su aplicación no se limita a un único tipo de ensayo.
¿Qué diferencia hay entre Mila y AiGOR?
Mila diseña los primers/sondas que se usan en la reacción de PCR; AiGOR es la tecnología de detección basada en RNA que se integra en la línea Elevia. Son capas distintas y complementarias del mismo kit.