חלק מעמוד התווך של יסודות ותקינה במרכז הלמידה של TAAG. מעמיק במה שראינו על פירוש יחידות יוצרות מושבות (CFU) ובשלב ההעשרה המיקרוביולוגית.
תוכן העניינים
לתוצאה מיקרוביולוגית תמיד יש טווח
דוח אומר "Salmonella: לא התגלתה ב-25 גרם" או "אווירניים מזופיליים: 1.2 × 105 CFU/g". שתי התוצאות נראות סופיות, אך אף אחת אינה כזו לגמרי. הראשונה תלויה בהסתברות שהשיטה תגלה את התאים המעטים שאולי נמצאים במנה שנותחה. השנייה היא הערכה עם פיזור שבמיקרוביולוגיה גדול בהרבה מאשר בניתוח כימי. הבנת הטווחים האלה היא שמאפשרת להחליט נכון כשתוצאה נמצאת קרוב לגבול.
מדוע המיקרוביולוגיה שונה
חיידקים אינם מתפזרים במזון כמו חומר מומס. הם חלקיקים דיסקרטיים, לעיתים מקובצים, וכשהם בריכוז נמוך נוכחותם במנת הבדיקה היא עניין של מקרה. אם באצווה יש בממוצע תא אחד של Salmonella לכל 25 גרם, חלק ממנות ה-25 גרם לא יכילו אף תא, אחרות יכילו אחד ואחרות שניים או יותר. פיזור אקראי זה מתנהג לפי התפלגות פואסון, וקובע גבול תיאורטי שאף שיטה אינה יכולה לעבור.
התקרה התיאורטית של כל שיטה
בהתפלגות פואסון, ההסתברות שמנה תכיל לפחות תא אחד היא 1 − e−λ, כאשר λ הוא מספר התאים הממוצע במנה. בממוצע של 1 CFU למנה, ההסתברות היא כ-63%: אפילו שיטה מושלמת הייתה נכשלת ביותר משליש מהמקרים, פשוט משום שהתא אינו במנה. כדי להגיע ל-50% גילוי מספיק ממוצע של ln 2, כ-0.69 CFU למנה; כדי להגיע ל-95% דרושים כ-3 CFU למנה.
שיטות איכותניות: מ-LOD ל-LOD50
בשיטת גילוי (נוכחות או היעדר), גבול הגילוי אינו מבוטא כמספר קבוע, אלא כעקומת הסתברות גילוי (POD) כפונקציה של הזיהום. Wilrich ו-Wilrich תיארו ב-2009, ב-Journal of AOAC International, מודל סטטיסטי להערכת העקומה הזו ושל LODp, הזיהום שהשיטה מגלה בהסתברות p. הערך הנפוץ ביותר הוא ה-LOD50: הריכוז שבו השיטה נותנת תוצאה חיובית במחצית מהמנות שנותחו.
ה-LOD50 מאפשר להשוות שיטות זו לזו ולתקרה התיאורטית. ISO 16140-2 משתמש בו לחישוב רמת הגילוי היחסית (RLOD) בין שיטה חלופית לשיטת הייחוס, ו-ISO 16140-3 מבקש מכל מעבדה להעריך את ה-eLOD50 שלה בעת אימות שיטה ולוודא שהוא אינו עולה על פי ארבעה מזה של הולידציה. ההליך מוסבר במאמר על ולידציה ואימות של שיטות.
מה פירוש "היעדר ב-25 גרם"
תוצאה שלילית פירושה שהשיטה לא גילתה את המיקרואורגניזם באותה מנה, ולא שהאצווה נקייה ממנו. לכן קריטריוני היעדר מיושמים על כמה יחידות דגימה, ולכן שלב ההעשרה חשוב כל כך: הוא מאפשר לתא בודד, פעמים רבות פגוע, להתרבות עד רמות הניתנות לגילוי. כמה יחידות לנתח ואיזו הסתברות לגלות אצווה מזוהמת מציעה כל תוכנית מפורט במאמר על תוכניות דגימה לפי מאפיינים.
שיטות כמותיות: גבול הכימות
בספירה בצלחת, הגבול התחתון נקבע לפי הדילול הקטן ביותר שנזרע. אם זורעים 1 מ"ל מדילול 10−1 ולא צומחת אף מושבה, התוצאה אינה "0 CFU/g", אלא "פחות מ-10 CFU/g" (בדוגמת המדריך של ISO 19036, עם שני דילולים ללא מושבות, הגבול המחושב הוא 9.1 CFU/g). דיווח "0" הוא אחת מטעויות הפרשנות שכבר הערנו עליהן במאמר על CFU.
אי-ודאות מדידה בספירות: ISO 19036:2019
ISO/IEC 17025 דורש ממעבדות מוסמכות להעריך את אי-הוודאות של הבדיקות שלהן. לספירות במיקרוביולוגיה של מזון, הייחוס הוא ISO 19036:2019, שפורסם באוקטובר 2019 כסקירה של המפרט הטכני מ-2006. המצגת של קבוצת העבודה של ISO מזכירה שתוצאות כמותיות במיקרוביולוגיה משתנות מאוד, בסדר גודל של 0.1 עד 1 log10.
שלושת המרכיבים
- אי-ודאות טכנית: השונות של שלבי הניתוח (שקילה, דילולים, זריעה, הדגרה, ספירה, אישור, אצוות מצעים, אנליסטים). היא מוערכת מועדף כסטיית התקן של יכולת השחזור התוך-מעבדתית (sIR), בניתוח של לפחות 10 דגימות עם שתי תוצאות לכל אחת בתנאים המשתנים כמו בשגרה. בדרך כלל זה המרכיב הגדול ביותר.
- אי-ודאות מטריצה: באיזו מידה מנת הבדיקה אינה מייצגת את דגימת המעבדה. לנוזלים או לדגימות שהומוגנו היטב ניתן להשתמש בערך קבוע של 0.1 log10; במזונות מוצקים או מרובי רכיבים הוא יכול להיות גדול בהרבה.
- אי-ודאות התפלגותית: השונות האקראית של פואסון. היא מחושבת מסך המושבות שנספרו (0.4343/√ΣC ב-log10) ומשפיעה בעיקר כשסופרים מעט מושבות.
אי-ודאות מורחבת וכיצד מדווחים
המרכיבים משולבים כשורש ריבועי של סכום ריבועיהם, והתוצאה מוכפלת בגורם כיסוי k = 2, המתאים בקירוב לרמת ביטחון של 95%. התקן מאפשר גם אפשרות מפושטת, להשתמש רק ביכולת השחזור, תוך אזהרה שהיא עלולה להמעיט באי-הוודאות במזונות מוצקים או ברמות נמוכות.
הדוגמה במדריך של ISO ממחישה זאת היטב: ספירה של 1.00 × 105 CFU/g, עם אי-ודאות מורחבת של 0.31 log10, מדווחת כ-5.00 ± 0.31 log10 CFU/g. בערכים טבעיים, הטווח נע בין 4.90 × 104 ל-2.04 × 105 CFU/g: יותר מפי שניים בין קצה לקצה.
מה אי-הוודאות אינה כוללת
ISO 19036 משאיר בחוץ שני מקורות שגיאה. הראשון הוא אי-ודאות הדגימה, שגיאת הוצאת דגימת המעבדה מהאצווה, שיכולה להיות גדולה אך אינה מיוחסת למעבדה. השני הוא ההטיה: במיקרוביולוגיה של מזון אין ערך "אמיתי" שאינו תלוי בשיטה שאפשר להשוות אליו תוצאה שגרתית.
מהמספר להחלטה
דמיינו ספירה של 1.2 × 102 CFU/g מול גבול של 100 CFU/g. עם אי-ודאות מורחבת טיפוסית של כמה עשיריות log, הערך האמיתי יכול להיות מתחת לגבול. האם המוצר עומד או לא? התשובה תלויה בכלל ההחלטה. ISO/IEC 17025 מבקש שכאשר המעבדה מצהירה על התאמה, היא תתעד את הכלל שבו היא משתמשת ואת הסיכון לקבל או לדחות בטעות. קריטריון נפוץ רואה תוצאה כלא תואמת רק אם היא עוברת את הגבול ביותר מהאי-ודאות המורחבת; אחר, שמרני יותר, רואה כתואם רק את מה שנמצא מתחת לגבול פחות אי-הוודאות הזו. הבחירה ביניהם היא החלטת ניהול סיכונים, ולא פרט של המעבדה.
טעויות נפוצות
- לקרוא "לא התגלה" כערובה להיעדר בכל האצווה.
- להשוות שיטות רק לפי זמן התגובה שלהן, בלי לבדוק את ה-LOD50 שלהן במטריצה הרלוונטית.
- לדווח "0 CFU/g" במקום "< גבול הכימות".
- להתייחס להפרשים של 0.2 או 0.3 log בין שתי ספירות כאל שינוי אמיתי בתהליך.
- לבקש הצהרת התאמה בלי להסכים תחילה על כלל ההחלטה.
סיכום
במיקרוביולוגיה, תוצאה לעולם אינה מגיעה לבדה: היא מגיעה עם הסתברות גילוי אם היא איכותנית ועם אי-ודאות אם היא כמותית. ה-LOD50 מאפשר להשוות שיטות ולהבין מה פירוש שלילי באמת; ISO 19036 מאפשר לתת טווח לכל ספירה. שימוש בטווחים האלה, יחד עם כלל החלטה מוסכם, הוא מה שמונע לשחרר או לדחות אצווה בגלל הבדל שהשיטה עצמה אינה יכולה להבחין בו.
על TAAG
גלו את נתוני הביצוע של ערכות הגילוי המולקולריות של TAAG, המבוססות על טכנולוגיית ה-RT-qPCR AiGOR™, וכיצד הם מתועדים בכל ולידציה.
שאלות נפוצות
מהו ה-LOD50 של שיטה מיקרוביולוגית?
זהו ריכוז המיקרואורגניזם שבו שיטת גילוי נותנת תוצאה חיובית ב-50% מהמנות שנותחו. משתמשים בו משום שבמיקרוביולוגיה הגילוי הוא הסתברותי: אפילו שיטה מושלמת מגיעה ל-50% גילוי רק עם כ-0.69 CFU בממוצע למנה, בשל הפיזור האקראי של התאים.
מדוע תוצאה "לא התגלה" אינה אפס?
משום שהשיטה מנתחת רק חלק מהדגימה ויש לה גבול גילוי. אם המיקרואורגניזם נמצא בריכוז נמוך או מפוזר באופן לא אחיד, הוא עלול לא להימצא במנה שנותחה או לא להגיע לרמות הניתנות לגילוי.
באיזה תקן משתמשים כדי להעריך את אי-הוודאות של ספירה מיקרוביולוגית?
ISO 19036:2019. הוא משלב את האי-ודאות הטכנית, של המטריצה וההתפלגותית, ומבטא את התוצאה כאי-ודאות מורחבת עם גורם כיסוי k = 2, בקירוב 95% ביטחון.
האם אי-ודאות המדידה כוללת את שגיאת הדגימה של האצווה?
לא. ISO 19036 שולל במפורש את אי-ודאות הדגימה, כלומר שגיאת הוצאת הדגימה מהאצווה. סיכון זה מנוהל בתכנון תוכנית הדגימה.
