Lernen

TAAG-Technologie

Mila: wie künstliche Intelligenz die Primer eines PCR-Kits gestaltet

TAAG-Team · 6 min Lesezeit · TOFU · Informativ

Dieser Artikel eröffnet die Säule TAAG-Technologie des Learning Centers. Weiter geht es mit künstlicher Intelligenz in der Mikrobiologie.

Das Problem, das Mila löst

Einen guten Primer oder eine Sonde für die PCR zu gestalten — die kurze Sequenz, die bestimmt, welche genetische Region amplifiziert und nachgewiesen wird — ist ein kombinatorisches Problem: Es existieren Millionen möglicher Kombinationen von Kandidatensequenzen, und die optimale zu wählen erfordert die gleichzeitige Bewertung von Spezifität (dass sie keine Nicht-Zielmikroorganismen erkennt), Sensitivität und Kompatibilität mit anderen Primern, wenn der Test multiplex sein soll. Das manuell zu tun ist ein langsamer Prozess, der von der Erfahrung des Designers abhängt.

Was ist Mila?

Mila ist, wie TAAG sie beschreibt, die weltweit erste Plattform, die künstliche Intelligenz nutzt, um automatisch die beste Kombination von Primern und Sonden unter Millionen möglicher Kombinationen zu gestalten und auszuwählen. Statt dass ein Spezialist manuell eine begrenzte Anzahl von Kandidaten bewertet, evaluiert das System erschöpfend den Kombinationsraum und wählt die mit der besten vorhergesagten Leistung aus.

Wo wird sie im TAAG-Katalog angewendet?

Mila ist eine übergreifende Technologie, integriert in die Kit-Linien Ampliora und Elevia von TAAG, was bedeutet, dass das KI-gestützte Design kein eigenständiges Produkt ist, sondern der Prozess hinter der Entwicklung der PCR-Kits selbst, die die Lebensmittelindustrie zum Nachweis von Krankheitserregern und Verderbniserregern nutzt.

Berichtete Vorteile gegenüber dem manuellen Design

Höhere Testpräzision

Durch die systematische Bewertung von mehr Kombinationen strebt die Plattform danach, Sensitivität und Spezifität des ausgewählten Primer/Sonden-Paars gegenüber dem zu maximieren, was eine begrenzte manuelle Auswahl erreichen würde.

Robustere multiplex-Designs

Eine der größten Herausforderungen der PCR multiplex besteht darin, zu verhindern, dass sich die verschiedenen Primersätze gegenseitig stören. Ein System, das Kombinationen in großem Maßstab bewertet, kann Sätze identifizieren, die diese Interferenz konsistenter minimieren als ein manueller Prozess.

Kürzere Entwicklungszeiten

TAAG berichtet, dass der Prozess vom Konzept eines neuen Kits bis zu seiner Verfügbarkeit dank Mila nur wenige Wochen dauern kann. (Von TAAG berichtete Zahl; die genaue Zeit kann je nach Komplexität des Tests variieren und muss fallweise bestätigt werden.)

Fazit

Die Gestaltung eines zuverlässigen PCR-Tests hängt von einer Entscheidung ab, die lange bevor die Probe das Labor erreicht, getroffen wird: welche exakte Sequenz gesucht werden soll. Diese Entscheidung mit künstlicher Intelligenz zu automatisieren, ist das, was Mila zur Entwicklung der TAAG-Kits beiträgt.

Über TAAG

Erfahren Sie, wie Mila Teil des Entwicklungsprozesses der Ampliora- und Elevia-Kits von TAAG ist.

Häufig gestellte Fragen

Ersetzt Mila den Analysten, der das finale Kit validiert?

Nein; Mila unterstützt in der Stufe des computergestützten Designs des Primers/der Sonde, aber das resultierende Kit durchläuft weiterhin eine experimentelle Validierung vor seiner Markteinführung.

Wird Mila nur für einen einzigen Kit-Typ verwendet?

Sie ist in mehr als eine Produktlinie von TAAG integriert (Ampliora und Elevia), sodass ihre Anwendung nicht auf einen einzigen Testtyp beschränkt ist.

Was unterscheidet Mila von AiGOR?

Mila gestaltet die Primer/Sonden, die in der PCR-Reaktion verwendet werden; AiGOR ist die RNA-basierte Nachweistechnologie, die in die Elevia-Linie integriert ist. Es sind unterschiedliche, sich ergänzende Ebenen desselben Kits.

Externe Quellen