Molekulare Identifizierung per NGS
16S oder ITS plus ein zweites Housekeeping-Gen, in unserem eigenen Labor sequenziert und mit öffentlichen, kuratierten Gendatenbanken verglichen.
5 Tage
Express-Service
10 Tage
Regulärer Service
15 Tage
Branchendurchschnitt
Jede Identifizierung wird in Ihrer eigenen historischen Datenbank erfasst.
Die Methode
Mikroorganismen derselben Gattung können sich sehr unterschiedlich verhalten. Eine falsche oder unzureichende Identifizierung kann bei Verderbsuntersuchungen zu ungeeigneten Kontrollstrategien führen.
Bakterien
Verbessert die taxonomische Auflösung, wenn 16S allein nahe verwandte Arten nicht ausreichend unterscheiden kann.
Pilze & Hefen
Verbessert die taxonomische Auflösung, wenn ITS allein nahe verwandte Arten nicht ausreichend unterscheiden kann.
MALDI-TOF
NGS bei TAAG
Anwendungen nach Branche
Häufigste Anwendung: Produktverderb. Den Organismus zu benennen verwandelt einen Defekt in eine überprüfbare mikrobiologische Erklärung.
USP <1113> legt fest, dass in Substanzen, Hilfsstoffen, Wasser, der Produktionsumgebung, Zwischenprodukten und Fertigprodukten nachgewiesene Mikroorganismen eine Charakterisierung erfordern können — einschließlich Identifizierung und, wo zutreffend, Stammtypisierung. Hier ist die Identifizierung häufig nicht optional.
Produktkontamination, Konservierungsfehler, unerwartete Ergebnisse im Challenge-Test. ISO 17516 legt Kriterien für die mikrobiologische Qualität fest; ISO 18415 behandelt den Nachweis spezifizierter und nicht spezifizierter Mikroorganismen.
„Was überlebt unsere Behandlung?“ Die Identifizierung zeigt, welche Art von Organismus kontrolliert wird — oder überlebt — bevor Sie entscheiden, was Sie ändern.
Repräsentative Szenarien
Fall 01 · Milchprodukte
Die Zählung zeigte Coliforme im Fertigprodukt, und der Betrieb musste wissen, worum es sich handelt, bevor über die Charge entschieden wurde: Es konnte ein pathogenes Enterobakterium sein. NGS identifizierte Klebsiella pneumoniae — nicht der befürchtete enterische Erreger, aber ein Opportunist, der auf eine Hygienelücke hinweist. Mit gesicherter Art konnte der Betrieb seinen Maßnahmenplan auf Prozesswasser und Biofilme im Füllkreislauf ausrichten.
Fall 02 · Wein
Im Weingut gärten Flaschen nach, und die traditionelle Methode kam nicht über „eine Hefe“ hinaus — ohne Ursache ließ sich nichts entscheiden. NGS identifizierte Zygosaccharomyces bailii: resistent gegen Sorbat und Benzoat in den üblichen Dosen und fähig, aus einem minimalen Inokulum nachzugären. Damit war klar, warum das Konservierungsmittel nicht griff, und das Weingut konnte seinen Maßnahmenplan auf Sterilfiltration und die Rekontaminationsstellen an der Füllung ausrichten.
Fall 03 · Brauerei
Im Spülwasser tauchten immer wieder dieselben Isolate auf, und die Brauerei befürchtete, sie könnten im Fertigprodukt landen. NGS identifizierte sie als Pseudomonas fluorescens und Bacillus licheniformis: typische Wasser- und Biofilmorganismen, nicht entwicklungsfähig in verpacktem Bier und außerhalb der Gruppe B. cereus. So konnte die Brauerei ihren Maßnahmenplan auf die Desinfektion des Wasserkreislaufs und die Beprobung der Stellen konzentrieren, an denen der Biofilm wiederkehrte.
Die Identifizierung belegt allein keine Kausalität — sie führt von „wir haben eine Kontamination“ zu „wir wissen, welche Mikroorganismen mit dem Problem verbunden sind, und können ihre Rolle untersuchen“.
Was wir hören / was wir liefern
„Wir haben ein Bakterium, einen Pilz oder eine Hefe gefunden, wissen aber nicht welche.“
Mikrobielle Identifizierung
„Unser Produkt verdirbt und wir haben einen Mikroorganismus gefunden.“
Identifizierung + Verderbsuntersuchung
„Wir finden immer wieder Kontamination an derselben Stelle.“
Identifizierung wiederkehrender Mikroorganismen
„Wir haben Mikroorganismen im Wasser.“
Identifizierung + Umgebungsuntersuchung
„Der Mikroorganismus überlebt unser Desinfektionsmittel.“
Identifizierung des Mikroorganismus
„Unsere konventionelle Methode kam nur bis zur Gattung.“
Molekulare Identifizierung mit höherer Auflösung
Preise & Angebotserstellung
Express (5 Tage) und regulär (10 Tage). Wiederkehrende Monitoringprogramme werden nach Volumen kalkuliert.
Ein Reinisolat oder das Fertigprodukt, in dem das Problem auftrat.
Bakterien oder Pilze/Hefen, Express oder regulär. Bei Produktproben gewinnen wir zuerst den Mikroorganismus.
16S oder ITS plus ein zweites Housekeeping-Gen, abgeglichen mit öffentlichen und kuratierten Gendatenbanken.
Auf Englisch oder Spanisch, und der Mikroorganismus wird in Ihre historische Datenbank aufgenommen.
FAQ
Bakterien, Hefen und Schimmelpilze.
Artniveau, wann immer die Marker es zulassen — genau deshalb fügen wir ein zweites Housekeeping-Gen hinzu.
Ein Reinisolat oder das Fertigprodukt, in dem das Problem auftrat, sowie Kontext: woher es stammt und was Sie untersuchen.
Die Identifizierung ist der Einstiegspunkt; Verderbs- und Umgebungsuntersuchungen bauen mit unserem Team für Labordienstleistungen darauf auf.
Organismen derselben Gattung können sich sehr unterschiedlich verhalten; eine unzureichende Identifizierung kann zu ungeeigneten Kontrollstrategien führen.
Fünf Tage im Express und zehn regulär, gegenüber einem Branchendurchschnitt von fünfzehn.
Sprechen Sie mit einem Spezialisten
Ein 30-minütiges Gespräch genügt, um Umfang, Servicelevel und den Inhalt Ihres Berichts zu definieren.
