Identificação molecular por NGS
16S ou ITS mais um segundo gene housekeeping, sequenciados no nosso próprio laboratório e comparados com bases de dados genéticas públicas e curadas.
5 dias
Serviço express
10 dias
Serviço regular
15 dias
Média do setor
Cada identificação fica registada na sua própria base de dados histórica.
O método
Microrganismos do mesmo género podem comportar-se de forma muito diferente. Uma identificação incorreta ou insuficiente pode conduzir a estratégias de controlo inadequadas em investigações de deterioração.
Bactérias
Melhora a resolução taxonómica quando o 16S por si só não permite discriminar adequadamente espécies próximas.
Fungos & leveduras
Melhora a resolução taxonómica quando o ITS por si só não permite discriminar adequadamente espécies próximas.
MALDI-TOF
NGS na TAAG
Aplicações por setor
Uso mais comum: deterioração do produto. Dar nome ao organismo transforma um defeito numa explicação microbiológica verificável.
A USP <1113> estabelece que os microrganismos detetados em substâncias, excipientes, água, ambiente de fabrico, intermediários e produtos acabados podem exigir caracterização — incluindo identificação e, quando aplicável, tipagem de estirpe. Aqui identificar, em muitos casos, não é opcional.
Contaminação de produtos, falhas de preservação, resultados inesperados em challenge testing. A ISO 17516 define critérios de qualidade microbiológica; a ISO 18415 cobre a deteção de microrganismos especificados e não especificados.
«O que está a sobreviver ao nosso tratamento?» A identificação indica que tipo de organismo está a ser controlado — ou a sobreviver — antes de decidir o que alterar.
Cenários representativos
Caso 01 · Lacticínios
A contagem mostrava coliformes no produto acabado e a fábrica precisava de saber o que eram antes de decidir sobre o lote: podia ser uma enterobactéria patogénica. O NGS identificou Klebsiella pneumoniae — não o patogénico entérico que temiam, mas um oportunista que sinaliza uma falha de higiene. Com a espécie confirmada, a fábrica pôde dirigir o seu plano de ação à água de processo e aos biofilmes do circuito de enchimento.
Caso 02 · Vinhos
A adega tinha garrafas a refermentar e o método tradicional não passava de «uma levedura», sem causa que sustentasse uma decisão. O NGS identificou Zygosaccharomyces bailii: resistente a sorbato e benzoato nas doses habituais e capaz de refermentar a partir de um inóculo mínimo. Isso explicou porque o conservante não continha o problema e permitiu à adega reorientar o seu plano de ação para a filtração esterilizante e os pontos de recontaminação no enchimento.
Caso 03 · Cervejaria
Na água de enxaguamento reapareciam sempre os mesmos isolados e a cervejaria temia que fossem parar ao produto acabado. O NGS identificou-os como Pseudomonas fluorescens e Bacillus licheniformis: microrganismos típicos de água e biofilme, incapazes de se desenvolver em cerveja embalada e fora do grupo B. cereus. A cervejaria pôde assim centrar o seu plano de ação na sanitização do circuito de água e na amostragem dos pontos onde o biofilme reaparecia.
A identificação não demonstra por si só causalidade — permite passar de «temos uma contaminação» para «sabemos que microrganismos estão associados ao problema e podemos investigar o seu papel».
O que ouvimos / o que entregamos
«Encontrámos uma bactéria, um fungo ou uma levedura, mas não sabemos qual.»
Identificação microbiana
«O nosso produto está a deteriorar-se e encontrámos um microrganismo.»
Identificação + investigação de deterioração
«Continuamos a encontrar contaminação no mesmo local.»
Identificação de microrganismos recorrentes
«Temos microrganismos na água.»
Identificação + investigação ambiental
«O microrganismo sobrevive ao nosso desinfetante.»
Identificação do microrganismo
«O nosso método convencional só chegou ao género.»
Identificação molecular de maior resolução
Preços & como orçamentar
Modalidades express (5 dias) e regular (10 dias). Os programas de monitorização recorrente são orçamentados por volume.
Um isolado puro, ou o produto acabado onde o problema surgiu.
Bactérias ou fungos/leveduras, express ou regular. Se enviar produto, recuperamos primeiro o microrganismo.
16S ou ITS mais um segundo gene housekeeping, comparados com bases de dados genéticas públicas e curadas.
Em inglês ou espanhol, e o microrganismo entra na sua base de dados histórica.
FAQ
Bactérias, leveduras e bolores.
Nível de espécie sempre que os marcadores o permitam — é precisamente por isso que acrescentamos um segundo gene housekeeping.
Um isolado puro ou o produto acabado onde o problema surgiu, mais contexto: de onde veio e o que está a investigar.
A identificação é o ponto de entrada; as investigações de deterioração e ambientais constroem-se sobre ela com a nossa equipa de serviços de laboratório.
Organismos do mesmo género podem comportar-se de forma muito diferente; uma identificação insuficiente pode conduzir a estratégias de controlo inadequadas.
Cinco dias em express e dez em regular, face a uma média da indústria de quinze.
Fale com um especialista
Uma chamada de 30 minutos basta para definir âmbito, nível de serviço e o que o seu relatório deve dizer.
