Moleculaire identificatie met NGS
16S of ITS plus een tweede housekeeping-gen, gesequenced in ons eigen laboratorium en vergeleken met openbare, gecureerde genetische databases.
5 dagen
Expressdienst
10 dagen
Reguliere dienst
15 dagen
Sectorgemiddelde
Elke identificatie wordt vastgelegd in uw eigen historische database.
De methode
Micro-organismen van hetzelfde geslacht kunnen zich heel verschillend gedragen. Een onjuiste of ontoereikende identificatie kan leiden tot ongeschikte beheersstrategieën bij bederfonderzoek.
Bacteriën
Verbetert de taxonomische resolutie wanneer 16S alleen nauw verwante soorten niet voldoende kan onderscheiden.
Schimmels & gisten
Verbetert de taxonomische resolutie wanneer ITS alleen nauw verwante soorten niet voldoende kan onderscheiden.
MALDI-TOF
NGS bij TAAG
Toepassingen per sector
Meest voorkomende toepassing: productbederf. Het organisme benoemen maakt van een defect een toetsbare microbiologische verklaring.
USP <1113> stelt dat micro-organismen die worden aangetroffen in stoffen, hulpstoffen, water, de productieomgeving, tussenproducten en eindproducten karakterisering kunnen vereisen — inclusief identificatie en, waar van toepassing, stamtypering. Hier is identificeren vaak niet optioneel.
Productcontaminatie, falende conservering, onverwachte resultaten bij challenge testing. ISO 17516 stelt criteria voor microbiologische kwaliteit; ISO 18415 dekt de detectie van gespecificeerde en niet-gespecificeerde micro-organismen.
„Wat overleeft onze behandeling?” Identificatie laat zien welk type organisme wordt beheerst — of overleeft — voordat u besluit wat u verandert.
Representatieve scenario’s
Case 01 · Zuivel
De telling liet coliformen zien in het eindproduct en de fabriek moest weten wat het was voordat er over de batch werd beslist: het kon een pathogene enterobacterie zijn. NGS identificeerde Klebsiella pneumoniae — niet de gevreesde enterische ziekteverwekker, maar een opportunist die op een hygiënelek wijst. Met de soort bevestigd kon de fabriek haar actieplan richten op proceswater en biofilms in het vulcircuit.
Case 02 · Wijn
Bij de wijnmakerij hergistten flessen en de traditionele methode kwam niet verder dan „een gist”, zonder oorzaak om een beslissing op te baseren. NGS identificeerde Zygosaccharomyces bailii: bestand tegen sorbaat en benzoaat in de gebruikelijke doseringen en in staat te hergisten vanaf een minimaal inoculum. Daarmee was duidelijk waarom het conserveermiddel niet werkte en kon de wijnmakerij haar actieplan verleggen naar steriele filtratie en de hercontaminatiepunten bij het vullen.
Case 03 · Brouwerij
In het spoelwater doken steeds dezelfde isolaten op en de brouwerij vreesde dat ze in het eindproduct terecht zouden komen. NGS identificeerde ze als Pseudomonas fluorescens en Bacillus licheniformis: micro-organismen die typisch zijn voor water en biofilm, niet in staat zich in verpakt bier te ontwikkelen en buiten de groep B. cereus. Zo kon de brouwerij haar actieplan richten op sanitatie van het watercircuit en bemonstering van de punten waar de biofilm terugkeerde.
Identificatie bewijst op zichzelf geen causaliteit — het brengt u van „we hebben een besmetting” naar „we weten welke micro-organismen met het probleem samenhangen en kunnen hun rol onderzoeken”.
Wat wij horen / wat wij leveren
„We vonden een bacterie, schimmel of gist, maar we weten niet welke.”
Microbiële identificatie
„Ons product bederft en we vonden een micro-organisme.”
Identificatie + bederfonderzoek
„We vinden steeds besmetting op dezelfde plek.”
Identificatie van terugkerende micro-organismen
„We hebben micro-organismen in het water.”
Identificatie + omgevingsonderzoek
„Het micro-organisme overleeft ons desinfectiemiddel.”
Identificatie van het micro-organisme
„Onze conventionele methode kwam alleen tot het geslacht.”
Moleculaire identificatie met hogere resolutie
Tarieven & prijsopgave
Express (5 dagen) en regulier (10 dagen). Terugkerende monitoringprogramma’s worden op volume geprijsd.
Een zuiver isolaat, of het eindproduct waarin het probleem opdook.
Bacteriën of schimmels/gisten, express of regulier. Stuurt u product, dan halen wij eerst het micro-organisme eruit.
16S of ITS plus een tweede housekeeping-gen, vergeleken met publieke en gecureerde genetische databases.
In het Engels of Spaans, en het micro-organisme komt in uw historische database.
FAQ
Bacteriën, gisten en schimmels.
Soortniveau wanneer de markers dat toelaten — precies daarom voegen wij een tweede housekeeping-gen toe.
Een zuiver isolaat of het eindproduct waarin het probleem opdook, plus context: waar het vandaan komt en wat u onderzoekt.
Identificatie is het startpunt; bederf- en omgevingsonderzoek bouwen daarop voort met ons team laboratoriumdiensten.
Organismen van hetzelfde geslacht kunnen zich heel verschillend gedragen; een ontoereikende identificatie kan leiden tot ongeschikte beheersstrategieën.
Vijf dagen bij express en tien bij regulier, tegenover een branchegemiddelde van vijftien.
Spreek met een specialist
Een gesprek van 30 minuten is genoeg om scope, serviceniveau en de inhoud van uw rapport te bepalen.
