Identificación molecular por NGS
16S o ITS más un segundo housekeeping gene, secuenciados en nuestro propio laboratorio y comparados contra bases de datos genéticas públicas y curadas.
5 días
Servicio express
10 días
Servicio regular
15 días
Promedio de la industria
Cada identificación queda registrada en su propia base de datos histórica.
El método
Microorganismos del mismo género pueden comportarse de forma muy diferente. Una identificación incorrecta o insuficiente puede llevar a estrategias de control inadecuadas en investigaciones de deterioro.
Bacterias
Mejora la resolución taxonómica cuando el 16S por sí solo no permite discriminar adecuadamente entre especies cercanas.
Hongos y levaduras
Mejora la resolución taxonómica cuando ITS por sí solo no permite discriminar adecuadamente entre especies cercanas.
MALDI-TOF
NGS en TAAG
Aplicaciones por industria
Uso más común: deterioro de productos. Poner nombre al organismo convierte un defecto en una explicación microbiológica verificable.
La USP <1113> establece que los microorganismos detectados en sustancias, excipientes, agua, ambiente de fabricación, intermediarios y productos terminados pueden requerir caracterización — incluyendo identificación y, cuando corresponda, strain typing. Aquí identificar, en muchos casos, no es opcional.
Contaminación de productos, fallos de preservación, resultados inesperados durante challenge testing. La ISO 17516 establece criterios de calidad microbiológica; la ISO 18415 cubre la detección de microorganismos especificados y no especificados.
«¿Qué microorganismo está sobreviviendo a nuestro tratamiento?» La identificación indica qué tipo de organismo está siendo controlado — o sobreviviendo — antes de decidir qué acción tomar.
Escenarios representativos
Caso 01 · Lácteos
El recuento daba coliformes en producto terminado y la planta necesitaba saber qué eran antes de decidir sobre el lote: podía tratarse de una enterobacteria patógena. El NGS identificó Klebsiella pneumoniae — no el patógeno entérico que temían, pero sí un oportunista que señala una brecha de higiene. Con la especie confirmada, la planta pudo dirigir su plan de acción al agua de proceso y a los biofilms del circuito de llenado.
Caso 02 · Vinos
La bodega tenía botellas refermentando y el método tradicional solo llegaba a «una levadura», sin una causa que sustentara la decisión. El NGS identificó Zygosaccharomyces bailii: resistente a sorbato y benzoato en las dosis habituales y capaz de refermentar desde un inóculo mínimo. Eso explicó por qué el conservante no contenía el problema y permitió a la bodega reorientar su plan de acción hacia la filtración esterilizante y los puntos de recontaminación en llenado.
Caso 03 · Cervecería
En el agua de enjuague reaparecían siempre los mismos aislados y la cervecería temía que acabaran en producto terminado. El NGS los identificó como Pseudomonas fluorescens y Bacillus licheniformis: microorganismos típicos de agua y biofilm, incapaces de desarrollarse en cerveza envasada y fuera del grupo B. cereus. Con eso, la cervecería pudo centrar su plan de acción en la sanitización del circuito de agua y en el muestreo de los puntos donde el biofilm reaparecía.
La identificación no demuestra por sí sola causalidad — permite pasar de «tenemos una contaminación» a «sabemos qué microorganismos están asociados al problema y podemos investigar su posible papel».
Lo que escuchamos / lo que entregamos
«Encontramos una bacteria, hongo o levadura, pero no sabemos cuál es.»
Identificación microbiana
«Nuestro producto se está deteriorando y encontramos un microorganismo.»
Identificación + investigación de deterioro
«Seguimos encontrando contaminación en el mismo lugar.»
Identificación de microorganismos recurrentes
«Tenemos microorganismos en el agua.»
Identificación + investigación ambiental
«El microorganismo sobrevive a nuestro desinfectante.»
Identificación del microorganismo
«Nuestro método convencional solo llegó a género.»
Identificación molecular de mayor resolución
Precios y cómo cotizar
Modalidades express (5 días) y regular (10 días). Los programas de monitoreo recurrente se cotizan por volumen.
Un aislado puro, o el producto terminado en el que apareció el problema.
Bacterias u hongos/levaduras, express o regular. Si nos envía producto, recuperamos primero el microorganismo.
16S o ITS más un segundo housekeeping gene, comparados contra bases de datos genéticas públicas y curadas.
En inglés o español, y el microorganismo ingresa a su base de datos histórica.
Preguntas frecuentes
Bacterias, levaduras y hongos.
Nivel de especie siempre que los marcadores lo permitan — por eso añadimos un segundo housekeeping gene.
Un aislado puro o el producto terminado donde apareció el problema, más contexto: de dónde salió y qué está investigando.
La identificación es el punto de entrada; las investigaciones de deterioro y ambientales se construyen sobre ella con nuestro equipo de servicios de laboratorio.
Microorganismos del mismo género pueden comportarse de forma muy diferente; una identificación insuficiente puede llevar a estrategias de control inadecuadas.
Cinco días en servicio express y diez en regular, frente a un promedio de industria de quince.
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Una llamada de 30 minutos basta para definir alcance, nivel de servicio y qué debe decir su informe.
